年調ソフトで控除証明書がインポートできないときに確認することと代替手段

年調ソフトに控除証明書を取り込めないときは、形式・年分・対応条件を確認し、原因に応じて再取得や代替提出へ進みます。

提出期限が近い場合は、原因調査と並行して、勤務先に手入力や証明書の別途提出が可能か相談してください。取り込みできないことと、控除を受けられないことは別の問題です。

この記事は、国税庁・マイナポータル・証明書発行会社の公式情報を編集部が中立に整理したものです。参照日は2026年10月16日です。個別の申告内容や提出方法は、勤務先の年末調整担当者に確認してください。

年調ソフトに控除証明書をインポートできないときは、この順に確認

最初に「使っているソフト」と「取り込むデータ」を分けます。国税庁の年調ソフトと、勤務先が契約する給与・労務システムでは、同じ名前の操作でも対応条件が異なります。

国税庁のFAQでは、保険会社などが発行するものを「控除証明書等データ」、年調ソフトで作成する申告書を「控除申告書データ」と区別しています。国税庁版には、給与システムへの送信・連携機能はありません。（出典: 国税庁「年調ソフトに関するFAQ」凡例・問1－4、2026年10月参照）

症状別チェック表から該当する対処へ進む

症状・状況	先に確認する点	進む節
ファイルを選べない、形式不正と出る	証明書か申告書か、XMLかZIPか	取り込み先とファイル形式
XMLを編集・保存した可能性がある	元データから変更したか	元のデータの再取得
年分違い、対応していないと出る	証明書の年分とソフトの対象年分	年分・版・対応条件
iOSで作った申告書をWindowsへ移すとE033が出る	申告書データの移行か	E033の回避手順
有効期限切れと出る	発行元と、期限切れとされた証明書の種類	電子証明書の期限エラー
国民年金の一部データだけ取り込めない	分割申告用の再交付・見込み額の条件	非対応データと代替提出

取り込み画面が求めるファイルと操作の目的を確認する

保険会社の証明書XMLを取り込む操作と、年調ソフトで作った申告書データを取り込む操作は別です。ファイル名だけでなく、取得元と用途で判断してください。

データ	取得元・作成元	用途
控除証明書等の電子データ	保険会社、マイナポータルなど	保険料などの証明内容を申告書作成に使う
控除申告書データ	国税庁の年調ソフト	作成した申告内容を勤務先へ渡す、別端末で扱う
年調ソフトから出力したPDF	国税庁の年調ソフト	書面提出や申告内容の目視確認に使う

国税庁のFAQ問1－2によると、電子提出用の出力では、作成した控除申告書データと取り込んだ控除証明書等データをZIPにまとめます。書面出力を選ぶとPDFも作成されます。この提出用ZIPと、保険会社から取得した証明書XMLを混同しないでください。（出典: 国税庁「年調ソフトに関するFAQ」問1－2・問1－3、2026年10月参照）

ファイル選択で止まった場合の進め方

• 取り込もうとしているものが、発行元の証明書か、作成済みの申告書かを確認する。
• ファイル選択画面に表示される形式と、手元の拡張子を照合する。
• 指定と異なる場合は、拡張子を変更せず、取得元の電子データまたは正しい出力データを用意する。
• 形式が合っているのに拒否される場合は、年分・版の確認へ進む。

国税庁版の配布案内・操作資料は、国税庁「年末調整控除申告書作成用ソフトウェア」から確認できます。対象年分と使用OSに対応する案内を選び、「控除証明書」と「控除申告書」のどちらの取り込み説明かを見分けてください。（出典: 国税庁「年末調整控除申告書作成用ソフトウェア」、2026年10月参照）

XMLを編集・保存した場合は元のデータを再取得する

文字が並んで見える、内容が表示されないという理由だけで、XMLの破損とは判断できません。証明書データを読みやすくするための自己編集は避けてください。

マイナポータルのFAQ No:6964では、お知らせに届いた控除証明書等の電子ファイルの内容を、そのまま確認できない場合の案内が掲載されています。表示の見え方と、年調ソフトで読み込めるかどうかは分けて考えます。（出典: デジタル庁・マイナポータル「お知らせに届いた控除証明書等の電子ファイルの内容を確認することができません。なぜですか。」、2026年10月参照）

これまでの操作	次にすること
開いて表示しただけで保存していない	表示だけを理由に破損と決めず、指定の取り込み先で試す
文字・金額・文字コードなどを変更して保存した	編集したファイルは使わず、発行元から再取得する
保存したか分からない	元の電子データを再取得して切り分ける

再取得後も失敗したら、同じ操作を繰り返さない

再取得したデータは、編集したファイルと保存先を分けてください。取り込み後に発行元・対象年分・金額が反映されたかを確認し、同じエラーが続く場合は対応条件または問い合わせへ進みます。

マイナポータルの通知画面に不慣れな方は、マイナポータルで育児休業給付の通知を確認する手順も画面の見方の参考になります。ただし、控除証明書とは別の通知を扱った記事です。

対象年分・ソフトのバージョン・証明書の対応条件を確認する

年分が異なると、取り込めない場合や申告に使用できない場合があります。対象年分と利用ソフトの対応条件を確認してください。

• 証明書の対象年分と、申告しようとしている年分を照合する。
• 起動したソフトの対象年分を確認し、前年用を使っていないか見る。
• 勤務先のシステムでは、受付対象の証明書・年分・形式を社内案内と照合する。

国税庁の2026年10月のFAQは、同月リリースの年調ソフトを対象としています。手元のソフトの対象年分・対応環境は、配布案内と照合してください。民間システムに国税庁版の対応条件をそのまま適用しないようにします。（出典: 国税庁「年調ソフトに関するFAQ」凡例・問1－1、「年末調整控除申告書作成用ソフトウェア」、2026年10月参照）

E033はiOSからWindowsへの申告書データ移行かを確認する

ここで扱うE033は、iOS端末で作った控除申告書データをWindows版などへ取り込む場面の事象です。保険会社の証明書XMLを直接取り込む操作とは区別してください。

国税庁のFAQ問5－55には、この条件で「E033 以下の申請書データについてはインポートできませんでした」などと表示される場合の回避策が示されています。（出典: 国税庁「年末調整手続の電子化及び年調ソフト等に関するよくある質問（FAQ）」問5－55、2026年10月参照）

該当する場合は、パスワードなしZIPをWindows側で再圧縮する

• iOS側の年調ソフトから、パスワードなしのZIPデータ（nopass.zip）を出力する。
• 勤務先が認める方法で、取り込み先のWindows端末へ渡す。
• Windows側でそのZIPを解凍する。
• 解凍したデータをWindows側で再びZIP形式に圧縮する。
• 再圧縮したZIPを使って、申告書データの取り込みを試す。

この回避策は、上記のOS間移行に該当する場合のものです。証明書XMLの内容を変更する手順ではありません。（出典: 国税庁「年末調整手続の電子化及び年調ソフト等に関するよくある質問（FAQ）」問5－55、2026年10月参照）

実行後の状態	次の行動
取り込めた	申告内容と証明書の反映を確認して提出へ進む
同じエラーが続く	元端末・取り込み先のOS、ソフトの版、再圧縮後の結果を控えて相談する
そもそも証明書XMLの取り込みで起きている	この回避策を流用せず、形式の確認へ戻る

電子証明書の有効期限エラーは、控除証明書の無効と同じではない

「有効期限切れ」が、XMLに付いている商業登記電子証明書を指している場合があります。控除証明書そのものの有効性と分けて確認します。

東京海上日動火災保険のFAQ No:11803によると、同社の該当エラーは商業登記電子証明書の有効期限切れによるものです。同社は、発行日時点で有効な商業登記電子証明書が付いていれば、控除証明書として問題ないことを国税庁にも確認済みと案内しています。年末調整ソフトでエラーが出る場合の確認先は、勤務先の年末調整担当者です。（出典: 東京海上日動火災保険「保険料控除証明書電子データ(XML)をアップロードしたら、有効期限切れでエラーと表示されました。証明書は無効ですか？」、2026年10月参照）

• 東京海上日動の該当データなら、上記FAQとエラー全文を勤務先へ伝える。
• 他社の証明書なら、この回答を一般化せず、発行元と勤務先に確認する。
• 証明書の署名部分や日付を自分で書き換えない。

勤務先には「このデータを別の方法で受け付けられるか」「手入力と証明書の別途提出に切り替えるか」を相談してください。取り込みを通すためだけに、保険契約の変更などを検討する必要はありません。

社会保険料控除証明書の非対応条件と、申告を止めない代替経路

国税庁版には、形式がXMLでもインポートに対応していない社会保険料控除証明書データがあります。再取得を繰り返す前に、次の条件と照合してください。

データの条件	国税庁版での扱い・確認点
前納分を各年に分割して申告するために再交付されたデータ	インポート非対応。「前納」という名称だけでなく、分割申告用の再交付かを確認する
4月から8月分の未納等により見込み額が算出されず、支払額が0円になるデータ	インポート非対応。0円表示だけで判断せず、見込み額が算出されない条件と合わせて確認する
前納の証明書だが、分割申告用の再交付ではない	前納という理由だけでは、上記の非対応条件に該当すると判断しない

上表は国税庁の年調ソフトに関する条件です。民間システムの対応可否とは分けて確認してください。（出典: 国税庁「年調ソフトでインポート対応していない社会保険料控除証明書データについて」、2026年10月参照）

非対応や未解決なら、手入力と証明書の提出方法を相談する

勤務先に「取り込み非対応の条件に該当するため、証明書に基づく手入力で申告してよいか」「証明書はどの方法で、いつまでに提出するか」を確認してください。取り込んだ際の0円表示を、そのまま申告すべき金額とは扱わないでください。

QRコード付き証明書への変換は、国税庁の「QRコード付証明書等作成システム」の操作案内で確認できます。変換は年調ソフトへのインポートを修復する操作ではなく、書面利用のための別経路です。提出の組合せは勤務先に確認してください。（出典: 国税庁「使ってみよう！QRコード付証明書等作成システム」、2026年10月参照）

解決しない場合は、この情報をまとめて問い合わせる

問い合わせでは「取り込めない」だけでなく、何をどこへ取り込んだかを伝えます。提出期限が迫っている場合は、原因の確認と代替提出の相談を同時に進めてください。

問い合わせテンプレートと相談先

困りごと	相談先・伝えること
勤務先システムでの受付、提出期限、代替提出	人事・給与担当へ、エラー全文と希望する提出方法を相談
証明書の取得・再交付、データ内容	発行元へ、証明書の種類・対象年分・再取得結果を伝える
国税庁版の操作・仕様	国税庁の年調ソフト案内に掲載された問い合わせ先へ、上記テンプレートの情報を伝える

国税庁版の問い合わせは、「年末調整控除申告書作成用ソフトウェア」の案内ページに進み、問い合わせ先の案内を確認してください。連絡前にFAQの該当する問番号も控えておくと、相談対象を伝えやすくなります。（出典: 国税庁「年末調整控除申告書作成用ソフトウェア」、2026年10月参照）

よくある質問

XMLを開いてしまったら、もう使えませんか？

開いて表示したことだけで、取り込み不能とは判断できません。編集や保存の有無で対応を分け、変更した可能性がある場合は再取得の確認表へ進んでください。

文字化けしているXMLを印刷して提出できますか？

そのまま印刷する方法ではなく、書面利用に対応した変換が必要です。国税庁は、電子データからQRコード付き証明書を作成するシステムの操作案内を公開しています。勤務先に必要な証明書の提出方法を確認したうえで利用してください。（出典: 国税庁「使ってみよう！QRコード付証明書等作成システム」、2026年10月参照）

取り込めないときの次の一手

• 形式・年分・ファイル変更の問題なら、対応するデータを用意して再試行する。
• iOSからWindowsへの申告書移行でE033が出るなら、公式FAQに基づく再圧縮手順へ進む。
• 非対応データや期限エラーなら、勤務先に代替提出を相談する。

国税庁のFAQでは、年調ソフトから電子データと書面提出用データを作成する方法が案内されています。勤務先が受け付ける方法を確認し、取り込みだけにこだわらず提出まで進めてください。（出典: 国税庁「年調ソフトに関するFAQ」問1－2・問1－3、2026年10月参照）